64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3172 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3172  putative amidase protein  100 
 
 		 344 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.633031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3156  amidase  51.75 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  27.55 
 
 		 495 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  29.74 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.54 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  27.12 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3772  Amidase  27.88 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.28 
 
 		 475 aa  56.2  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.25 
 
 		 485 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  28.79 
 
 		 463 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.2 
 
 		 486 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3371  amidase  30.04 
 
 		 469 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  27.07 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.04 
 
 		 485 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  28.68 
 
 		 487 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  25.75 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  25.64 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  28.63 
 
 		 469 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  28.4 
 
 		 468 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2854  amidase  23.08 
 
 		 596 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  30.65 
 
 		 447 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  29.11 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  26.53 
 
 		 467 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  25.49 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  28.57 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  27.11 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3381  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.65 
 
 		 485 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  27.98 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17500  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  39.36 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  29.33 
 
 		 509 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  28.64 
 
 		 470 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  26.98 
 
 		 498 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4036  Amidase  28.65 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  26.81 
 
 		 526 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  31.38 
 
 		 490 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4068  Amidase  28.65 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.04 
 
 		 480 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  28.39 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  40.7 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  28.24 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  29.13 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4286  amidase  27.76 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508501  normal  0.0108693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.04 
 
 		 475 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.9 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  30.14 
 
 		 547 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3928  amidase  28.09 
 
 		 491 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0519913  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  23.87 
 
 		 549 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  27.64 
 
 		 474 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  28.57 
 
 		 463 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0507  amidase  28.74 
 
 		 481 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.69 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  22.11 
 
 		 485 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1302  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.1 
 
 		 491 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.584243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  35.48 
 
 		 471 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0218  Amidase  26.88 
 
 		 469 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0507638  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  34.62 
 
 		 484 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.17 
 
 		 486 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  24.06 
 
 		 494 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1951  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.67 
 
 		 490 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.759727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2561  amidotransferase (amidase)  25.81 
 
 		 477 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  28.28 
 
 		 473 aa  43.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.34 
 
 		 488 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  23.79 
 
 		 483 aa  42.7  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>