More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1926 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04124  valyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 951 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3739  valyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 951 aa  643    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 880 aa  726    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2045  valyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 887 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0977  valyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 948 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29141  valyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 947 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 909 aa  716    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1228  valyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 876 aa  696    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0887446  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2097  valyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 921 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.694852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0923  valyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 959 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 881 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0738  valyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 973 aa  688    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 883 aa  692    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21531  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 933 aa  683    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0606355  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3424  valyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 958 aa  682    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1268  valyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 948 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 881 aa  735    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 881 aa  734    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 881 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0927  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 955 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0785  valyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 921 aa  660    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0756  valyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 921 aa  665    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1086  valyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 948 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1850  valyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 984 aa  669    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.546477  normal  0.957317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3085  valyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 943 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405108 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1281  valyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 933 aa  684    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.202707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 879 aa  801    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0577  valyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 912 aa  670    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3112  valyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 958 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 1002 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1846  valyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 955 aa  647    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344373  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1091  valyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 929 aa  700    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0986  valyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 948 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 885 aa  766    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4585  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 955 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0386  valyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 901 aa  668    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.673451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2213  valyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 925 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.198562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0388  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 902 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.427268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2558  valyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 914 aa  691    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0956  valyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 887 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2839  valyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 883 aa  770    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1503  valyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 924 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000330515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 881 aa  735    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0422  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 955 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1775  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 918 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.651419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 909 aa  707    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0742  valyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 926 aa  649    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 879 aa  681    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 880 aa  819    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2633  valyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 955 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2390  valyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 1052 aa  668    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 884 aa  761    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 904 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1460  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 955 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1369  valyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 922 aa  691    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 884 aa  800    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0091  valyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 943 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1669  valyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 955 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4102  valyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 1006 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2867  valyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 968 aa  660    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2896  valyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 976 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.588712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2922  valyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 947 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.611801  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18731  valyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 918 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.122386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2138  valyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 984 aa  679    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2630  valyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 955 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00324916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0132  valyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 929 aa  681    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0741  valyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 955 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1691  valyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 955 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18921  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 918 aa  663    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1535  valyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 853 aa  636    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3564  valyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 921 aa  679    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1571  valyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 926 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 880 aa  751    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 880 aa  754    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1259  valyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 948 aa  645    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 911 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1130  valyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 958 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00231601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1201  valyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 958 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.418789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0555  valyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 917 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036551 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0916  valyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 968 aa  669    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.276486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 883 aa  783    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 893 aa  706    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1321  valyl-tRNA synthetase  38.44 
 
 		 955 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14440  valyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 950 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2479  valyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 880 aa  664    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 902 aa  687    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1219  valyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 879 aa  700    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 894 aa  706    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 883 aa  699    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18731  valyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 918 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0192  valyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 892 aa  764    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.209132  normal  0.584595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1474  valyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 929 aa  692    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0304029  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1131  valyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 958 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00349082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 888 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1580  valyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 886 aa  787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2029  valyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 904 aa  640    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0790  valyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 953 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0684  valyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 917 aa  721    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.980667  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0393  valyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 952 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 897 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>