More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1554 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1554  aminotransferase class I and II  100 
 
 
378 aa  770    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.536521  normal  0.0197179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06320  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  46.42 
 
 
373 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.112376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.68 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.37 
 
 
370 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.67 
 
 
379 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  30.65 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.78 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.26 
 
 
360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.77 
 
 
351 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.61 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.06 
 
 
361 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  25.92 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.89 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  29.24 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  28.82 
 
 
364 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  28.82 
 
 
364 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  28.82 
 
 
364 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  28.53 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  28.82 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.69 
 
 
366 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  28.61 
 
 
864 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.86 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.25 
 
 
358 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  27.19 
 
 
863 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  25.92 
 
 
366 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  26.22 
 
 
863 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1447  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 
332 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.15 
 
 
362 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  26.69 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  26.01 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2148  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.95 
 
 
357 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  27.17 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.37 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.43 
 
 
361 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2464  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.43 
 
 
357 aa  97.1  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.275573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  22.93 
 
 
358 aa  95.9  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.32 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  28.9 
 
 
359 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  24.86 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3453  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  26.76 
 
 
496 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  24 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1406  aminotransferase, class I and II  29.74 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000645732  normal  0.305169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  23.34 
 
 
362 aa  94  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2087  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.69 
 
 
498 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.787862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  24.29 
 
 
354 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  27.73 
 
 
852 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  22.97 
 
 
351 aa  90.9  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  26.39 
 
 
356 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  24.01 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  22.92 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.59 
 
 
360 aa  89.7  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  28.57 
 
 
367 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.06 
 
 
348 aa  89.4  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.02 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1249  histidinol-phosphate aminotransferase  22.92 
 
 
367 aa  86.3  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.109002  normal  0.0431111 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02161  aminotransferase class-I  21.84 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  26.27 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  24.49 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  24.05 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0940  aminotransferase, class I and II  26.44 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.240572  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2310  histidinol-phosphate aminotransferase  26.35 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357051 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2089  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  24.16 
 
 
498 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  24.43 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  23.88 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  23.18 
 
 
362 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3005  histidinol-phosphate aminotransferase  25.41 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13886  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  26.5 
 
 
858 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1185  histidinol-phosphate aminotransferase  22.61 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.318294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0978  histidinol-phosphate aminotransferase  25.41 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811497  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  23.91 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.93 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  24.93 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1205  histidinol-phosphate aminotransferase  21.93 
 
 
380 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  25.14 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  25.95 
 
 
386 aa  79.3  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  29.11 
 
 
371 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0745  aminotransferase  25.93 
 
 
331 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  25.98 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  25.22 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  24.51 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  24.85 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  26.72 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  26.38 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  25.42 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  21.55 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02741  aminotransferases class-I  22.6 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  24.65 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  21.87 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1565  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  22.6 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  28.74 
 
 
354 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  21.9 
 
 
358 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  26.25 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  25.83 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  25.22 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  25.43 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  24.44 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  25.22 
 
 
348 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  22.84 
 
 
350 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  24.03 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2749  histidinol-phosphate aminotransferase  22.61 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>