149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1678 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1684  ThiJ/PfpI domain protein  99.65 
 
 
283 aa  587  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000959624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2068  chaperone protein HchA  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000391461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1678  chaperone protein HchA  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1218  chaperone protein HchA  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00819366  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0916  chaperone protein HchA  100 
 
 
283 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000778732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2198  chaperone protein HchA  99.65 
 
 
283 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2746  chaperone protein HchA  99.29 
 
 
283 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  normal  0.255888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01882  chaperone protein HchA  98.6 
 
 
219 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2046  chaperone protein HchA  64.26 
 
 
282 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0351  chaperone protein HchA  61.21 
 
 
286 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1576  chaperone protein HchA  58.89 
 
 
290 aa  349  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44285  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2246  chaperone protein HchA  61.17 
 
 
292 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26502  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0574  chaperone protein HchA  55.67 
 
 
292 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.683174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0588  chaperone protein HchA  55.67 
 
 
292 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49710  chaperone protein HchA  55.63 
 
 
291 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2506  chaperone protein HchA  53.55 
 
 
291 aa  311  6.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739881  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5029  chaperone protein HchA  51.76 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0646455  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5831  chaperone protein HchA  51.76 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4348  chaperone protein HchA  51.76 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3049  chaperone protein HchA  52.13 
 
 
293 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383894  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2968  chaperone protein HchA  45.96 
 
 
290 aa  255  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  29.86 
 
 
219 aa  79  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.24 
 
 
284 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  27.8 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  27.69 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  22.08 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  24.68 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  23.72 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  24.21 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.85 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  24.09 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  27.73 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  27.1 
 
 
933 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  29.92 
 
 
224 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.5 
 
 
231 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  22.13 
 
 
221 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  28.23 
 
 
226 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.8 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.8 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.66 
 
 
238 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  25.35 
 
 
229 aa  60.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  25.1 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  24.18 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
219 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  25.1 
 
 
250 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  25.1 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  24.14 
 
 
234 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  23 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  24.64 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  24.31 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  25.79 
 
 
229 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  24.22 
 
 
279 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  23 
 
 
220 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  23.5 
 
 
220 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  24.5 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.14 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.95 
 
 
227 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.1 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.14 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.3 
 
 
232 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.3 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.3 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.67 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.13 
 
 
223 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.09 
 
 
230 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  24.3 
 
 
230 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  26.44 
 
 
234 aa  52.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  27.41 
 
 
227 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.49 
 
 
242 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.36 
 
 
224 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  27.41 
 
 
227 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  25 
 
 
279 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  27.41 
 
 
227 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  25.74 
 
 
224 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.62 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  22.98 
 
 
232 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.25 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.67 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  30.25 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  31.2 
 
 
225 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  32.39 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.59 
 
 
228 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  30.94 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.5 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  27.17 
 
 
237 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  23.17 
 
 
223 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  27.22 
 
 
227 aa  49.3  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  26.59 
 
 
226 aa  49.3  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>