162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01882 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01882  chaperone protein HchA  100 
 
 		 219 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1684  ThiJ/PfpI domain protein  99.07 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000959624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0916  chaperone protein HchA  98.6 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000778732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2068  chaperone protein HchA  98.6 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000391461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1678  chaperone protein HchA  98.6 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1218  chaperone protein HchA  98.6 
 
 		 283 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00819366  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2746  chaperone protein HchA  98.6 
 
 		 283 aa  441  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  normal  0.255888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2198  chaperone protein HchA  98.13 
 
 		 283 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234174  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2046  chaperone protein HchA  62.67 
 
 		 282 aa  281  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0351  chaperone protein HchA  59.91 
 
 		 286 aa  275  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1576  chaperone protein HchA  58.26 
 
 		 290 aa  271  5.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2246  chaperone protein HchA  60.1 
 
 		 292 aa  262  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0574  chaperone protein HchA  54.42 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.683174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0588  chaperone protein HchA  54.42 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49710  chaperone protein HchA  54.05 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2506  chaperone protein HchA  52.75 
 
 		 291 aa  237  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3049  chaperone protein HchA  50.23 
 
 		 293 aa  225  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5029  chaperone protein HchA  48.84 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0646455  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5831  chaperone protein HchA  48.84 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4348  chaperone protein HchA  48.84 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2968  chaperone protein HchA  47.71 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  30.56 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  24.02 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  29.49 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  29.41 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01950  conserved hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  25.98 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.18 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  29.19 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  31.5 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  24.88 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  24.04 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.78 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.78 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  27.4 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.22 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  26.29 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  27.1 
 
 		 933 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  25.86 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.16 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  25.69 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  25.33 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  24 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  25.7 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  24 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  24.5 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.92 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  24.77 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.15 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  25.38 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.53 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.23 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  25.59 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.23 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.23 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  27.4 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.33 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  24.77 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.5 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  28.36 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.95 
 
 		 258 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.13 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.44 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  31.78 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.93 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.08 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.94 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06796  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01430)  28.05 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.73 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  25.93 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  32.37 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  25.74 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  26.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  26.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3847  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.96 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  26.29 
 
 		 366 aa  52  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  29.76 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  25.93 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  23.6 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  25.93 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  23.74 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  24.87 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  26.96 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  23.41 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  22.54 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  26.51 
 
 		 257 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  26.44 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  23.94 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  24.27 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>