140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4348 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5029  chaperone protein HchA  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0646455  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5831  chaperone protein HchA  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4348  chaperone protein HchA  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3049  chaperone protein HchA  90.78 
 
 		 293 aa  552  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.383894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49710  chaperone protein HchA  74.22 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2506  chaperone protein HchA  62.98 
 
 		 291 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0574  chaperone protein HchA  61.17 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.683174  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0588  chaperone protein HchA  61.17 
 
 		 292 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2246  chaperone protein HchA  59.85 
 
 		 292 aa  348  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0351  chaperone protein HchA  56.1 
 
 		 286 aa  342  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1576  chaperone protein HchA  56.84 
 
 		 290 aa  338  8e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.44285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2046  chaperone protein HchA  55.12 
 
 		 282 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2746  chaperone protein HchA  52.11 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  normal  0.255888 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1684  ThiJ/PfpI domain protein  52.11 
 
 		 283 aa  305  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000959624  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2068  chaperone protein HchA  51.76 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000391461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1678  chaperone protein HchA  51.76 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  0.121369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1218  chaperone protein HchA  51.76 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00819366  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0916  chaperone protein HchA  51.76 
 
 		 283 aa  305  9.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000778732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2198  chaperone protein HchA  51.41 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2968  chaperone protein HchA  43.37 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01882  chaperone protein HchA  48.84 
 
 		 219 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3900  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.93 
 
 		 233 aa  92.4  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3683  ThiJ/PfpI domain protein  31.58 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  28.33 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1896  ThiJ/PfpI domain protein  23.87 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.815712  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  28.09 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1143  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.77 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.505852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4585  ThiJ/PfpI domain protein  28.8 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.034255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1157  ThiJ/PfpI domain protein  28.23 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  25.1 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.11 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  24.02 
 
 		 219 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.6 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1831  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.71 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.6 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2435  ThiJ/PfpI  24.31 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0616899  normal  0.239889 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  25.83 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  26.27 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  25.41 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  26.19 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06810  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01210)  25.23 
 
 		 933 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.977304  normal  0.681153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  26.27 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  26.05 
 
 		 230 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  25.81 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1713  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.12 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45636 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3191  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.12 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  25.21 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  25.21 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5033  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.48 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1679  ThiJ/PfpI domain protein  23.41 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  26.56 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  25.88 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  24.67 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.24 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  25 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00030  cysteine-type peptidase, putative  24.89 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.329282  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  26.99 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1929  ThiJ/PfpI domain protein  26.48 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25350  putative intracellular protease/amidase  26.53 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.779211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  26.89 
 
 		 227 aa  57  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.66 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0592  ThiJ/PfpI domain protein  28.11 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.18 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22600  putative intracellular protease/amidase  24.58 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.87 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0630  DJ-1/PfpI family protein  25.97 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.69 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0780  ThiJ/PfpI domain protein  25.97 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  24.02 
 
 		 234 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.03 
 
 		 227 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.81 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  22.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.73 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  23.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.31 
 
 		 242 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  23.63 
 
 		 254 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.9 
 
 		 228 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  26.32 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.73 
 
 		 229 aa  52.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.52 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 		 220 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  21.89 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  22.61 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.6 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2725  ThiJ/PfpI domain protein  24.43 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.693547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  21.78 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1154  intracellular protease, PfpI family  30.89 
 
 		 166 aa  48.5  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.25545e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  25.17 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  28.12 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  22.55 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  25.1 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  27.82 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  23.14 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.27 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>