230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2722 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  100 
 
 		 378 aa  771    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  41.4 
 
 		 376 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  41.42 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  40.07 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  46.31 
 
 		 230 aa  175  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.44 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 		 234 aa  163  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.1 
 
 		 258 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  42.57 
 
 		 226 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  38.71 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  39.82 
 
 		 223 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.74 
 
 		 235 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.37 
 
 		 238 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  41.12 
 
 		 228 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  35.37 
 
 		 257 aa  149  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  38.74 
 
 		 227 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  38.12 
 
 		 229 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  31.71 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  37.84 
 
 		 221 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  36.89 
 
 		 224 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  37.12 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  40.38 
 
 		 233 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  36.07 
 
 		 220 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  37.22 
 
 		 221 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.92 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  36.24 
 
 		 230 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  36.07 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  36.53 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  36.07 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  38.25 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  33.93 
 
 		 230 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  36.07 
 
 		 220 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  35.81 
 
 		 230 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  39.72 
 
 		 226 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  34.5 
 
 		 228 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.98 
 
 		 232 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.98 
 
 		 230 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  36.07 
 
 		 220 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  35.81 
 
 		 229 aa  133  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  31.68 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 		 237 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  37.98 
 
 		 230 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  35.62 
 
 		 220 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  34.23 
 
 		 219 aa  131  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  31.62 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  37.04 
 
 		 227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.5 
 
 		 209 aa  130  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  35.68 
 
 		 230 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 		 231 aa  130  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  35.4 
 
 		 226 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  35.16 
 
 		 219 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  35.4 
 
 		 230 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.24 
 
 		 228 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  34.42 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  33.78 
 
 		 224 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.05 
 
 		 225 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  36.56 
 
 		 227 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  34.04 
 
 		 234 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  34.21 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.51 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.41 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  38.05 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.71 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.1 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  37.89 
 
 		 245 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  33.19 
 
 		 227 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.77 
 
 		 232 aa  124  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.74 
 
 		 227 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  33.78 
 
 		 235 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.45 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  37.37 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.23 
 
 		 231 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.98 
 
 		 224 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  35.87 
 
 		 230 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  32.59 
 
 		 226 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.44 
 
 		 230 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 		 228 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  35.37 
 
 		 225 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  30.93 
 
 		 260 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.93 
 
 		 260 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  33.63 
 
 		 227 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  35.65 
 
 		 231 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  34.62 
 
 		 223 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.62 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  33.63 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  29.2 
 
 		 232 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  35.11 
 
 		 225 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.96 
 
 		 227 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  37.23 
 
 		 228 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  36.28 
 
 		 230 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.08 
 
 		 249 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  32.24 
 
 		 227 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  35.4 
 
 		 225 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  34.67 
 
 		 224 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  34.67 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>