More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3438 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3438  intracellular protease/amidase-like  100 
 
 
366 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000319638 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  45.15 
 
 
357 aa  335  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  41.42 
 
 
378 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0621  ThiJ/PfpI domain protein  35.96 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.121561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  40 
 
 
230 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  43.11 
 
 
223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.26 
 
 
232 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  38.57 
 
 
227 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
238 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.82 
 
 
235 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 
237 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.1 
 
 
258 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.99 
 
 
237 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  37.99 
 
 
254 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  39.11 
 
 
230 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 
230 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  36.21 
 
 
228 aa  157  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  39.64 
 
 
226 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  36.77 
 
 
229 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  38.57 
 
 
220 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  38.57 
 
 
220 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  38.22 
 
 
224 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  38.74 
 
 
221 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 
261 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.06 
 
 
232 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  38.12 
 
 
220 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  37.22 
 
 
219 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  38.12 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  38.12 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  38.29 
 
 
221 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  37.67 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  39.05 
 
 
233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  38.1 
 
 
226 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  37.67 
 
 
220 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.97 
 
 
234 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  34.36 
 
 
228 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  35.09 
 
 
232 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  34.58 
 
 
245 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  31.42 
 
 
260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  36.44 
 
 
257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 
224 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.42 
 
 
260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
228 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  37.21 
 
 
229 aa  140  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 
226 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  37.78 
 
 
225 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 
235 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  31.86 
 
 
227 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  32.75 
 
 
246 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  34.22 
 
 
227 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  34.07 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.29 
 
 
209 aa  137  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 
227 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  33.19 
 
 
273 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 
223 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  33.19 
 
 
230 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  35.09 
 
 
228 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
231 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  34.38 
 
 
230 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  33.19 
 
 
250 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 
225 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  33.92 
 
 
230 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 
225 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.11 
 
 
227 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  34.22 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  33.93 
 
 
223 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.93 
 
 
232 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.93 
 
 
230 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.93 
 
 
230 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.32 
 
 
225 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.27 
 
 
224 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  34.36 
 
 
227 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.19 
 
 
242 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  32.89 
 
 
230 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 
230 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.56 
 
 
225 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  32.89 
 
 
228 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  35.56 
 
 
230 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  30.84 
 
 
227 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
230 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.84 
 
 
225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  34.38 
 
 
225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.06 
 
 
225 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
227 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  35.11 
 
 
225 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  33.77 
 
 
230 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  34.07 
 
 
224 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  35.59 
 
 
224 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.05 
 
 
228 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  34.68 
 
 
230 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  30.53 
 
 
227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.81 
 
 
223 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.24 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.51 
 
 
231 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  32.46 
 
 
267 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  35.37 
 
 
231 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  34.96 
 
 
228 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  33.33 
 
 
227 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>