197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2964 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
226 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  55.56 
 
 
230 aa  275  6e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.4 
 
 
227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  46.43 
 
 
273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.2 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.44 
 
 
228 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 
231 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  43.24 
 
 
228 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.24 
 
 
228 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.29 
 
 
232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  43.24 
 
 
229 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  43.24 
 
 
229 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  43.36 
 
 
235 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  42.79 
 
 
227 aa  190  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  43.18 
 
 
227 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  43.18 
 
 
227 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  43.18 
 
 
227 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.29 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  42.34 
 
 
229 aa  188  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  41.67 
 
 
232 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  41.1 
 
 
228 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  38.84 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.84 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  41.1 
 
 
227 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  41.1 
 
 
228 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  39.29 
 
 
227 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.04 
 
 
234 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  39.22 
 
 
250 aa  175  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.47 
 
 
237 aa  174  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  41.1 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  40.44 
 
 
234 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  39.29 
 
 
227 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 
237 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  40.44 
 
 
228 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  41.41 
 
 
261 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 
232 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  40.44 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  40.97 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  37.78 
 
 
230 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  36.49 
 
 
229 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 
227 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  36.49 
 
 
224 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  37.55 
 
 
230 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  39.73 
 
 
223 aa  147  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  37.89 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.75 
 
 
235 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  43.9 
 
 
166 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.71 
 
 
229 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  34.8 
 
 
227 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 
230 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.89 
 
 
225 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  35.56 
 
 
245 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
230 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
232 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  36.74 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.48 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.56 
 
 
227 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 
230 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.67 
 
 
225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  35.14 
 
 
227 aa  138  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 
225 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.43 
 
 
258 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  36 
 
 
230 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  35.11 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  35.24 
 
 
267 aa  135  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  33.78 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  35.56 
 
 
230 aa  134  9e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  34.36 
 
 
226 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  36 
 
 
221 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  33.33 
 
 
226 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  34.22 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.67 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.04 
 
 
228 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  36.28 
 
 
220 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.93 
 
 
227 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  39.76 
 
 
175 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  35.4 
 
 
225 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  32.3 
 
 
230 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  35.84 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  32.89 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  32.89 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.11 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  35.84 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  36.82 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  35.84 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.43 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1285  DJ-1/PfpI family protein  34.82 
 
 
357 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  32.89 
 
 
225 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  35.84 
 
 
220 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  34.12 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  33.19 
 
 
225 aa  128  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  32 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>