36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1030 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  858    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  50 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  48.92 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  50.12 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  48.92 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2557  hypothetical protein  45.69 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  25.51 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  26.36 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  31.43 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.96 
 
 		 1357 aa  50.8  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1510 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.91 
 
 		 446 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.19 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  29.25 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1552 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  31.43 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  31.43 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  22.55 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  20.57 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  26.57 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  29.13 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.56 
 
 		 1609 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.83 
 
 		 444 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 442 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  28.21 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1196 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.95 
 
 		 947 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  28.3 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.57 
 
 		 1686 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.66 
 
 		 1194 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>