24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0564 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  866    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  50 
 
 		 419 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  52.49 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  50.72 
 
 		 418 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  48.44 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2557  hypothetical protein  46.97 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  26.91 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 556 aa  63.2  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  22.57 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  38.37 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.72 
 
 		 1609 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  28.77 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  30.07 
 
 		 1357 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.63 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.63 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.25 
 
 		 1686 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  31.3 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  30.36 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.66 
 
 		 969 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1367 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2357  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.69 
 
 		 684 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000735182  hitchhiker  0.000512118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.7 
 
 		 444 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0305  hypothetical protein  22.13 
 
 		 534 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>