38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0501 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  938    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  35.48 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  35.53 
 
 		 454 aa  262  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  25.28 
 
 		 534 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  25.16 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  20.96 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  22.57 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  24.18 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.72 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.92 
 
 		 1684 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.21 
 
 		 717 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  31.09 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  28.77 
 
 		 1059 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  33.04 
 
 		 1206 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1661  hypothetical protein  24.84 
 
 		 885 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.22 
 
 		 1599 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1236 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.08 
 
 		 1623 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.96 
 
 		 1163 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.46 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  23.83 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.67 
 
 		 1583 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  36.76 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.83 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  25.16 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 		 1190 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  20.57 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.33 
 
 		 1598 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1540  WD-40 repeat-containing protein  27.63 
 
 		 376 aa  45.1  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.279686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  22.1 
 
 		 969 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  20.64 
 
 		 919 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  30.41 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1401 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.53 
 
 		 590 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.32 
 
 		 572 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.37 
 
 		 1161 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.37 
 
 		 1161 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>