25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0304 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  863    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0564  hypothetical protein  52.49 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.242049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1030  hypothetical protein  48.92 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.417426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3707  hypothetical protein  46.39 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2712  hypothetical protein  45.56 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2557  hypothetical protein  41.77 
 
 		 451 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1023  hypothetical protein  24.34 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.452518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2425  hypothetical protein  21.25 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000103631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0501  hypothetical protein  20.96 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1553 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.82 
 
 		 1229 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1510 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1196 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.14 
 
 		 1557 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1552 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1661  hypothetical protein  23.39 
 
 		 885 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.247038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.82 
 
 		 1684 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.69 
 
 		 1357 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 1686 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1158  hypothetical protein  23.83 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.815616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.67 
 
 		 1609 aa  46.6  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3539  hypothetical protein  32.32 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  30.57 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 1363 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.34 
 
 		 1623 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>