45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1513 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1513  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000018853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1631  TPR domain-containing protein  93.66 
 
 		 268 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000235396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1376  TPR repeat-containing protein  95.9 
 
 		 268 aa  504  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0962  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2980  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.117357  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3238  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1879  TPR repeat-containing protein  37.39 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1045  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0307425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 892 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2418  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 821 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 1297 aa  46.2  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  43.33 
 
 		 466 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 543 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 927 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  29.63 
 
 		 821 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  31.82 
 
 		 338 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 142 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 878 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 4079 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 776 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 776 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.86 
 
 		 776 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 1737 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 810 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 466 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  40.24 
 
 		 875 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  34.85 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1421 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 776 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 776 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.83 
 
 		 465 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.37 
 
 		 465 aa  42.7  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.33 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2255  hypothetical protein  38.36 
 
 		 191 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 		 767 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  40 
 
 		 417 aa  42.7  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  34.33 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 471 aa  42.7  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 269 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3022  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 161 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 1127 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.07 
 
 		 439 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 718 aa  42  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>