22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1879 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1879  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3238  TPR repeat-containing protein  91.96 
 
 		 286 aa  457  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2980  TPR repeat-containing protein  58.74 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.117357  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1045  TPR repeat-containing protein  52.05 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0307425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1631  TPR domain-containing protein  36.43 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000235396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1513  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000018853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1376  TPR repeat-containing protein  36.32 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0962  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 595 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 828 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2067  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.885223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 594 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 878 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  33.73 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.21 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 486 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43701  predicted protein  44.44 
 
 		 572 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0547  tetratricopeptide repeat domain protein  33.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0590314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.57 
 
 		 810 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 146 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 3172 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 565 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>