33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43701 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43701  predicted protein  100 
 
 
572 aa  1187    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42733  predicted protein  25.52 
 
 
604 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.738056 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40924  predicted protein  24.84 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458934  normal  0.213634 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
750 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 
833 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.08 
 
 
887 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
2262 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  21.76 
 
 
773 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05740  Cell division control protein 23, putative  21.95 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
448 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 
222 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25.68 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
762 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 
352 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
732 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.7 
 
 
979 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  22.26 
 
 
1101 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3238  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 
286 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.79 
 
 
668 aa  45.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
614 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 
626 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
729 aa  44.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
568 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.53 
 
 
582 aa  44.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  23.55 
 
 
587 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.04 
 
 
545 aa  44.3  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2050  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  26.22 
 
 
258 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.36 
 
 
354 aa  44.3  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06138  Protein bimA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P17885]  26.92 
 
 
642 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112787  normal  0.294021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>