18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3238 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3238  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1879  TPR repeat-containing protein  91.96 
 
 		 285 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2980  TPR repeat-containing protein  56.83 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.117357  hitchhiker  0.00166052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1045  TPR repeat-containing protein  50.88 
 
 		 275 aa  224  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0307425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1631  TPR domain-containing protein  38.84 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000235396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1513  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000018853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1376  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 268 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0962  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  33.33 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43701  predicted protein  41.51 
 
 		 572 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 595 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 		 715 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2067  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.885223  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0547  tetratricopeptide repeat domain protein  31 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0590314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 594 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 878 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.94 
 
 		 565 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0990  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 146 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.140527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>