22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2418 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2418  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 332 aa  692    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2424  TPR repeat-containing protein  94.29 
 
 		 87 aa  156  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3045  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 516 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1376  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 268 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151893  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1513  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000018853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  32.35 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  34.94 
 
 		 2176 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  38.46 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1631  TPR domain-containing protein  25.62 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000235396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.36 
 
 		 974 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 448 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.67 
 
 		 564 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 767 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 213 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  37.5 
 
 		 576 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  30.34 
 
 		 172 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 729 aa  43.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  36.47 
 
 		 1120 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.4 
 
 		 1969 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>