36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2424 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2424  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 87 aa  184  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2418  TPR repeat-containing protein  94.29 
 
 		 332 aa  156  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3045  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2653  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 		 328 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 316 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 564 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1942  beta-lactamase-like  34.25 
 
 		 423 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 207 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  38.46 
 
 		 407 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.34 
 
 		 974 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 370 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 866 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  36.84 
 
 		 1367 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  39.06 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1969  tetratricopeptide TPR_2  33.9 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.467519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 927 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  29.85 
 
 		 820 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1376  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000151893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 822 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 729 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 729 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 461 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 767 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 306 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 297 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 448 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.18 
 
 		 297 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 224 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1897  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0935119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.27 
 
 		 730 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  29.85 
 
 		 821 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 512 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1513  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 268 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000018853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  29.85 
 
 		 823 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1631  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 		 268 aa  40  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000235396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>