185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1987 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1987  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  301  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  44.83 
 
 		 452 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0001  chromosomal replication initiation protein  45.28 
 
 		 579 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.62 
 
 		 449 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  40.91 
 
 		 450 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.22 
 
 		 474 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  27.1 
 
 		 445 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.28 
 
 		 584 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 		 450 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  40.28 
 
 		 445 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.26 
 
 		 453 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  36.84 
 
 		 507 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.75 
 
 		 463 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 518 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2553  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 561 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0301  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3182  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 525 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.54964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470928  normal  0.147682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 525 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2848  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08301  chromosomal replication initiation protein  33.75 
 
 		 463 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2237  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0089  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0103  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 533 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 524 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57647  hitchhiker  0.0000195718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  31.51 
 
 		 450 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0001  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 545 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 511 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0001  chromosomal replication initiation protein  31.75 
 
 		 492 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.983579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3239  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 536 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4462  chromosomal replication initiation protein  39.62 
 
 		 544 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369414  normal  0.111678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 506 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.25 
 
 		 511 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0001  chromosomal replication initiation protein  36.84 
 
 		 494 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 505 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2791  hypothetical protein  29.23 
 
 		 343 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2767  hypothetical protein  27.16 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000226296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2504  hypothetical protein  29.23 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000213839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2470  hypothetical protein  29.23 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0555269  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 511 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 510 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  28.57 
 
 		 489 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  31.51 
 
 		 451 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0001  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 487 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000189853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  31.51 
 
 		 451 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1938  chromosomal replication initiation protein  40.38 
 
 		 473 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3606  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.43 
 
 		 476 aa  47.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2743  hypothetical protein  35.82 
 
 		 341 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.15987e-19 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12738  chromosomal replication initiation protein  40.38 
 
 		 475 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.843582  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3714  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.25 
 
 		 458 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0883513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  32.86 
 
 		 461 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  32.81 
 
 		 449 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  32.35 
 
 		 446 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  32.5 
 
 		 477 aa  47.4  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.5 
 
 		 474 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0537995  normal  0.168321 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  31.73 
 
 		 443 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  31.08 
 
 		 461 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0565  chromosomal replication initiation protein  30.86 
 
 		 464 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 478 aa  47  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 468 aa  47  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00010  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 514 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.373198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0013  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 457 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000224276  hitchhiker  0.000759559 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 		 472 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  31.75 
 
 		 492 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2548  hypothetical protein  34.33 
 
 		 341 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0863711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2735  hypothetical protein  34.33 
 
 		 341 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.104304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  28.38 
 
 		 498 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 461 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.1 
 
 		 443 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06291  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 		 463 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05911  chromosomal replication initiation protein  37.14 
 
 		 464 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0001  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 		 512 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  34.55 
 
 		 462 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 462 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  27.38 
 
 		 481 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168448  unclonable  0.00000204804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  34.38 
 
 		 442 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 466 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.85 
 
 		 483 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 463 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 462 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  35.85 
 
 		 467 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>