71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0304 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  1013    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  39.52 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  41.76 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  39.96 
 
 		 443 aa  286  9e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  39.66 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  36.94 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  36.9 
 
 		 451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  39.07 
 
 		 487 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  35.57 
 
 		 450 aa  272  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  38.31 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  37.5 
 
 		 442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  33.77 
 
 		 438 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  34.57 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  36.11 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  37.53 
 
 		 465 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  35.5 
 
 		 465 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  32.81 
 
 		 445 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  37.82 
 
 		 451 aa  256  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  34.65 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  35.16 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  34.97 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  34.84 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  34.95 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  34.7 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  34.54 
 
 		 445 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  34.54 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  34.27 
 
 		 464 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  34.57 
 
 		 453 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  34.35 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  34.14 
 
 		 449 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  34.14 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  32.75 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  38.15 
 
 		 432 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  34.21 
 
 		 459 aa  239  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  35.95 
 
 		 444 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  37.58 
 
 		 432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  36.76 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  34.39 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  32.37 
 
 		 441 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  32.34 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  32.93 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  35.09 
 
 		 433 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  34.02 
 
 		 433 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  33.48 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  32.9 
 
 		 460 aa  210  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  32.83 
 
 		 456 aa  206  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  33.19 
 
 		 477 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  31.42 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  30.2 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  38.65 
 
 		 523 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  46.3 
 
 		 403 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1260  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 		 289 aa  47  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.447417 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4524  PDZ/DHR/GLGF  29.7 
 
 		 348 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.76 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.24 
 
 		 398 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1156  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  44.44 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1113  RIP metalloprotease RseP  44.44 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  48.78 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0351  membrane-associated zinc metalloprotease  40.98 
 
 		 549 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  41.07 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  31.48 
 
 		 498 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.5 
 
 		 511 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  55.17 
 
 		 505 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0574  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  52.5 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30609  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  39.58 
 
 		 402 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  36.51 
 
 		 474 aa  43.1  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.49 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  38.89 
 
 		 674 aa  43.5  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>