52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1326 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
451 aa  916    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  47.2 
 
 
451 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  45.16 
 
 
443 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  45.58 
 
 
442 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  46.19 
 
 
439 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  43.76 
 
 
438 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  45.85 
 
 
440 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  41.88 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  40.45 
 
 
451 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  39.77 
 
 
446 aa  342  8e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  39.73 
 
 
445 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  40.65 
 
 
430 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  41.8 
 
 
436 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  40 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  38.46 
 
 
450 aa  335  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  39.68 
 
 
448 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  38.75 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  38.75 
 
 
453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  40.28 
 
 
487 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  39.64 
 
 
445 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  40.98 
 
 
433 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  39.41 
 
 
445 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  39.16 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  40.42 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  40.93 
 
 
470 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  38.74 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  40.67 
 
 
433 aa  319  7e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  35.39 
 
 
501 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  36.08 
 
 
515 aa  316  5e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  43.1 
 
 
442 aa  316  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  38.07 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  40.18 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  39.54 
 
 
470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  39.16 
 
 
438 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  40 
 
 
459 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  38.6 
 
 
465 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  35.5 
 
 
508 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  39.33 
 
 
456 aa  305  8.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  36.36 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  39.3 
 
 
459 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  39.05 
 
 
449 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  39.06 
 
 
449 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  35.96 
 
 
433 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  35.27 
 
 
464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  37.36 
 
 
444 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  37.34 
 
 
496 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  33.71 
 
 
457 aa  246  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  35.51 
 
 
450 aa  239  5e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  32.89 
 
 
460 aa  238  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  31.63 
 
 
455 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  32 
 
 
477 aa  227  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05019  Methionine synthase, vitamin-B12 independent, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12060)  24.41 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.807041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>