61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1159 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  895    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  54.77 
 
 		 440 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  50.58 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  48.94 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  48.49 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  44.37 
 
 		 451 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  44.5 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  44.94 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  46.19 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  45.95 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  45.11 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  43.75 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  45.22 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  42.76 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  44.5 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  46.17 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  45.97 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  43.84 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  44.83 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  43.54 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  42.82 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  43.38 
 
 		 436 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  43.22 
 
 		 441 aa  362  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  43.35 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  43.35 
 
 		 445 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  41.44 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  41.37 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  41.9 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  41.9 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  45.63 
 
 		 432 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  45.88 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  38.89 
 
 		 464 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  39.86 
 
 		 453 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  39.4 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  40.77 
 
 		 456 aa  332  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  37.3 
 
 		 470 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  40.91 
 
 		 444 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  37.21 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  37.44 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  37.21 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  37.76 
 
 		 501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  38.99 
 
 		 433 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  36.33 
 
 		 515 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  39.66 
 
 		 496 aa  284  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  37.19 
 
 		 460 aa  259  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  35.92 
 
 		 457 aa  252  9.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  36.47 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  34.72 
 
 		 477 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  32.67 
 
 		 523 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  36.76 
 
 		 450 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  48.26 
 
 		 508 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  38.67 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  60.53 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  34.21 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  34.25 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  30.67 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  31.94 
 
 		 436 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  32.39 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  29.87 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0407  hypothetical protein  32.1 
 
 		 429 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0536782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  33.33 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>