55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1348 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  100 
 
 
450 aa  884    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  38.27 
 
 
440 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  35.29 
 
 
445 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  38.13 
 
 
451 aa  263  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  32.23 
 
 
454 aa  261  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  38.16 
 
 
452 aa  257  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  35.51 
 
 
451 aa  256  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  36.76 
 
 
443 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  39.29 
 
 
451 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  38.26 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  38.48 
 
 
465 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  35.39 
 
 
453 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  32.89 
 
 
450 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  35.31 
 
 
453 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  33.77 
 
 
438 aa  249  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  35.57 
 
 
487 aa  249  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  39.53 
 
 
436 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  36.76 
 
 
439 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  35.14 
 
 
501 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  36.2 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  35.08 
 
 
441 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  34.01 
 
 
464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  31.45 
 
 
438 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  39.91 
 
 
442 aa  243  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  37.61 
 
 
433 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  33.18 
 
 
433 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  34.32 
 
 
449 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  34.02 
 
 
449 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  36.79 
 
 
459 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  35.27 
 
 
465 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  37 
 
 
459 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  34.55 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  37.79 
 
 
470 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  35.39 
 
 
456 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  34.01 
 
 
445 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  34.01 
 
 
445 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  33.33 
 
 
460 aa  229  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  33.63 
 
 
442 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  38.6 
 
 
432 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  29.52 
 
 
470 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  34.12 
 
 
496 aa  224  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  36.34 
 
 
515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  37.62 
 
 
433 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  38.6 
 
 
432 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  37.16 
 
 
444 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  36.05 
 
 
430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  35.62 
 
 
455 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  33.68 
 
 
508 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  34.69 
 
 
457 aa  206  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  32.82 
 
 
523 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  34.2 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  40.68 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  29.94 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01990  Radical SAM domain protein  32 
 
 
447 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.412201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  45.28 
 
 
527 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>