56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1727 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  99.78 
 
 		 445 aa  895    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  896    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  45.96 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  46.7 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  46.01 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  43.92 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  43.35 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  42.79 
 
 		 440 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  40.32 
 
 		 443 aa  348  8e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  39.37 
 
 		 454 aa  336  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  38.9 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  38.23 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  39.64 
 
 		 451 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  38.7 
 
 		 453 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  38.48 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  37.18 
 
 		 446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  37.53 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  42.93 
 
 		 433 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  37.96 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  38.85 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  37.39 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  37.72 
 
 		 442 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  36.02 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  36.38 
 
 		 430 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  37.41 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  38.32 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  36.59 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  38.32 
 
 		 449 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  37.5 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  36.88 
 
 		 442 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  36.21 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  35.31 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  35.8 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  35.68 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  35.91 
 
 		 432 aa  275  8e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  33.87 
 
 		 444 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  35.59 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  34.68 
 
 		 459 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  34.54 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  34.68 
 
 		 459 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  34.83 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  32.84 
 
 		 501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  34.54 
 
 		 496 aa  250  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  33.71 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  31.7 
 
 		 523 aa  246  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  31.94 
 
 		 515 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  32.82 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  31.81 
 
 		 477 aa  216  8e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  34.01 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  45.18 
 
 		 508 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.71 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.498315  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  32 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.22 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.22 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 		 291 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>