55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1025 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  893    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  58.2 
 
 		 438 aa  520  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  52.21 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  48.73 
 
 		 438 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  45.96 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  45.96 
 
 		 445 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  46.12 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  43.31 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  45.93 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  44.94 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  45.41 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  43.19 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  40.45 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  40.52 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  40.65 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  41 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  41.18 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  40.72 
 
 		 453 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  41.88 
 
 		 452 aa  346  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  40.09 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  40.09 
 
 		 465 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  41.94 
 
 		 441 aa  344  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  42.45 
 
 		 451 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  40.37 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  39.73 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  41.46 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  41.16 
 
 		 448 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  38.64 
 
 		 465 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  39.68 
 
 		 449 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  39.32 
 
 		 449 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  41.36 
 
 		 456 aa  323  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  39.95 
 
 		 464 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  39.73 
 
 		 470 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  40.48 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  39.86 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  40.53 
 
 		 432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  38.84 
 
 		 487 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  39.05 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  37.5 
 
 		 459 aa  305  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  38.18 
 
 		 459 aa  302  8.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  35 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  35.03 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  35.7 
 
 		 508 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  36.82 
 
 		 444 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  32.22 
 
 		 523 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  33.03 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  33.93 
 
 		 477 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  35.29 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  32.81 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  32.23 
 
 		 460 aa  230  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  31.25 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  22.48 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  25.37 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  34.72 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.89 
 
 		 310 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>