56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06880 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
455 aa  932    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  56.43 
 
 
457 aa  517  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  56.35 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  42.86 
 
 
460 aa  329  5.0000000000000004e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  35.96 
 
 
443 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  36.47 
 
 
439 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  31.36 
 
 
438 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  36.68 
 
 
451 aa  238  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  33.33 
 
 
451 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  233  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  33.33 
 
 
445 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  35.47 
 
 
440 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  33.85 
 
 
453 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  33.41 
 
 
453 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  31.63 
 
 
451 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  34.59 
 
 
442 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  35.13 
 
 
430 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  31.25 
 
 
445 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  32.31 
 
 
487 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  35.71 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  31.1 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  29.91 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  33.64 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  33.94 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  33.56 
 
 
448 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  33.56 
 
 
436 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  34.24 
 
 
465 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  29.91 
 
 
438 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  29.11 
 
 
454 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  34.92 
 
 
433 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  32.74 
 
 
442 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  33.04 
 
 
432 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  33.79 
 
 
465 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  32.49 
 
 
456 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  33.72 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  30.83 
 
 
523 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  34.93 
 
 
450 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  31.29 
 
 
464 aa  199  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  33.86 
 
 
465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  32.44 
 
 
432 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  31.59 
 
 
470 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  34.08 
 
 
515 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  28.47 
 
 
449 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  28.47 
 
 
449 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  30.61 
 
 
459 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  30.45 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  31.29 
 
 
470 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  33.13 
 
 
501 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  42.86 
 
 
508 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  30.11 
 
 
496 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  33.33 
 
 
408 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  36 
 
 
408 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  32 
 
 
409 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  33.33 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>