20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1316 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  837    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  61.37 
 
 
408 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  61.37 
 
 
408 aa  525  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  58.92 
 
 
409 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  58.92 
 
 
408 aa  491  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  52.94 
 
 
411 aa  441  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  52.11 
 
 
409 aa  435  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  48.89 
 
 
413 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  36.99 
 
 
436 aa  294  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  37.74 
 
 
455 aa  293  5e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  36.3 
 
 
436 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  37.14 
 
 
436 aa  290  4e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  36.3 
 
 
436 aa  289  6e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  36.23 
 
 
477 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 
395 aa  46.6  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
421 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  30 
 
 
455 aa  45.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3317  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 
355 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.355052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  28.99 
 
 
449 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  32.88 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>