23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1632 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  836    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  71.01 
 
 
408 aa  597  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  66.09 
 
 
409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  62.9 
 
 
408 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  61.37 
 
 
407 aa  532  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  55.22 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  53.56 
 
 
411 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  54.55 
 
 
413 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  39.9 
 
 
436 aa  333  4e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  42.34 
 
 
455 aa  330  2e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  40.63 
 
 
436 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  40.63 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  39.42 
 
 
436 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  25.64 
 
 
443 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  26.87 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 
333 aa  49.7  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5043  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  24.67 
 
 
363 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0411446  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  36 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  35.44 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  28.41 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3602  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  23.85 
 
 
498 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.95628  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  23.38 
 
 
440 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.81 
 
 
335 aa  43.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>