40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2512 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  834    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  62.9 
 
 
408 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  61.37 
 
 
407 aa  525  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  60.05 
 
 
408 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  58.23 
 
 
409 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  52.58 
 
 
411 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  51.97 
 
 
409 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  52.71 
 
 
413 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  40.15 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  40.1 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  39.61 
 
 
436 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  39.42 
 
 
436 aa  306  3e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  41.16 
 
 
455 aa  305  7e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  33.33 
 
 
455 aa  50.8  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0281  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0277  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0284  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0274  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.481355  hitchhiker  0.000000283417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3748  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247867  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0273  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000395705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0285  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.43 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4452  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.43 
 
 
326 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.93 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.62159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01990  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.412201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  33.78 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3524  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 
340 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  27.36 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.54 
 
 
333 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5904  nitrogenase FeMo cofactor biosynthesis protein NifB  25.22 
 
 
520 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  31.58 
 
 
477 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4120  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.64 
 
 
326 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3646  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.59 
 
 
519 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 
359 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  33.78 
 
 
442 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  34.72 
 
 
449 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4793  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.64 
 
 
326 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00113371  hitchhiker  0.00000239799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0704  radical SAM family protein  24.74 
 
 
384 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.503182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0204  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.91 
 
 
522 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.037885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>