58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3528 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2144  hypothetical protein  89.8 
 
 		 501 aa  918    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3528  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1043    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2747  protein of unknown function DUF512  65.67 
 
 		 508 aa  675    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3571  hypothetical protein  59.33 
 
 		 523 aa  605  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.630428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0401  protein of unknown function DUF512  47.07 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2107  protein of unknown function DUF512  39.79 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00107289  normal  0.222005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1883  FeS-containing oxidoreductase  38.19 
 
 		 451 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1323  hypothetical protein  40.67 
 
 		 443 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1466  putative Fe-S oxidoreductase  36.1 
 
 		 449 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.455289  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01681  putative Fe-S oxidoreductase  35.68 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.911896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1326  Fe-S oxidoreductase  36.08 
 
 		 451 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02221  putative Fe-S oxidoreductase  39.44 
 
 		 465 aa  312  9e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0632  hypothetical protein  36.98 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2331  Fe-S oxidoreductase  37.4 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0359  Fe-S oxidoreductase  36.78 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2541  FeS-containing oxidoreductase  35.54 
 
 		 448 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0459  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  35.65 
 
 		 441 aa  303  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01111  putative Fe-S oxidoreductase  34.02 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.980262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1225  protein of unknown function DUF512  40.61 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.767388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1984  hypothetical protein  33.62 
 
 		 438 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2244  FeS-containing oxidoreductase  34.92 
 
 		 453 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0102  putative Fe-S oxidoreductase  34.09 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.383242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01141  putative Fe-S oxidoreductase  33.06 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1159  hypothetical protein  36.33 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000801932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1025  hypothetical protein  35.03 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0603945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4507  hypothetical protein  36.42 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01131  putative Fe-S oxidoreductase  33.68 
 
 		 459 aa  288  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.104938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1968  hypothetical protein  36.38 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.161355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2296  FeS-containing organism-specific oxidoreductase  34.72 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00042763  normal  0.0619176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3382  protein of unknown function DUF512  37.04 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.322973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2391  hypothetical protein  34.57 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1173  hypothetical protein  39.46 
 
 		 451 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2966  hypothetical protein  37.45 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0640841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1631  protein of unknown function DUF512  32.06 
 
 		 454 aa  272  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1997  PDZ domain-containing protein  37.91 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0347733  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1774  hypothetical protein  35.45 
 
 		 430 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0164491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2132  protein of unknown function DUF512  33.55 
 
 		 438 aa  259  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00526746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0990  protein of unknown function DUF512  35.25 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000932101  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01101  putative Fe-S oxidoreductase  31.63 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.277769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3279  protein of unknown function DUF512  35.82 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1727  hypothetical protein  31.94 
 
 		 445 aa  240  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.519845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2009  hypothetical protein  31.94 
 
 		 445 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2049  hypothetical protein  35.03 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101437  hitchhiker  0.0000000146402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0981  protein of unknown function DUF512  35.53 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000360347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0750  protein of unknown function DUF512  30.6 
 
 		 433 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.874468 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0727  protein of unknown function DUF512  32.04 
 
 		 460 aa  221  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0961895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1336  protein of unknown function DUF512  32.43 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.506965 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1348  protein of unknown function DUF512  36.34 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  32.14 
 
 		 457 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  34.08 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  40 
 
 		 476 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  25.62 
 
 		 459 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0407  hypothetical protein  27.42 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0536782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  35.21 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  43.14 
 
 		 476 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  43.14 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.35 
 
 		 335 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>