More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3540 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3540  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 451 aa  933    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5955  adenylosuccinate lyase  69.51 
 
 		 446 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.676724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1563  adenylosuccinate lyase  66.67 
 
 		 456 aa  624  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2933  adenylosuccinate lyase  66.44 
 
 		 448 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5015  adenylosuccinate lyase  68.39 
 
 		 448 aa  614  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06215  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 445 aa  612  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  63.09 
 
 		 447 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  63.53 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  52 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  51.78 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  50.33 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  52.58 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  50.55 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  50.33 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  51.33 
 
 		 456 aa  461  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  52.13 
 
 		 457 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  52.8 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  52 
 
 		 455 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  51.45 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  50.78 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  49.11 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  49.11 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  48.77 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  49.11 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  51.79 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  52.57 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  50.78 
 
 		 453 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  49.11 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  49.11 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 478 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  48.1 
 
 		 455 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 455 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  49 
 
 		 455 aa  438  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 451 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 456 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  49 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 454 aa  438  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  49.1 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  51.11 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 		 457 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  46.98 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  48.56 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 455 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  47.78 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  48.12 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>