More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0892 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  84.4 
 
 
455 aa  795    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  81.98 
 
 
455 aa  761    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  98.68 
 
 
455 aa  922    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
465 aa  952    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  65.33 
 
 
455 aa  608  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  65.69 
 
 
455 aa  604  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  62.95 
 
 
453 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  64.52 
 
 
456 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  62.53 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  63.86 
 
 
472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  64.08 
 
 
456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  62.31 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  63.64 
 
 
456 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  62.97 
 
 
456 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  63.74 
 
 
456 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  63.29 
 
 
471 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  62.03 
 
 
456 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  62.1 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  62.64 
 
 
455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  62.61 
 
 
462 aa  571  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  60.66 
 
 
455 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  59.78 
 
 
455 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  62.31 
 
 
458 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  60.96 
 
 
456 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  61.28 
 
 
455 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  61.2 
 
 
462 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  61.11 
 
 
455 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  59.74 
 
 
457 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  61.17 
 
 
456 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  62.97 
 
 
457 aa  561  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  61.4 
 
 
459 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  60.57 
 
 
469 aa  557  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  61.56 
 
 
454 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  58.85 
 
 
458 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  60.36 
 
 
456 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  58.67 
 
 
465 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  60.26 
 
 
462 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3412  adenylosuccinate lyase  62.75 
 
 
458 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.507882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  60.3 
 
 
458 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 
460 aa  548  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  59.52 
 
 
457 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  60.59 
 
 
456 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  60.09 
 
 
456 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  59.91 
 
 
455 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 
456 aa  548  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
457 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4111  adenylosuccinate lyase  60.98 
 
 
457 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
462 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
462 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
462 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  59.3 
 
 
457 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  59.87 
 
 
483 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
462 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  60.04 
 
 
462 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 
456 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  58.94 
 
 
462 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  58 
 
 
455 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  60.36 
 
 
456 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  59.68 
 
 
456 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  58.94 
 
 
462 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  60.36 
 
 
456 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  59.82 
 
 
462 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  60.59 
 
 
456 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  59.91 
 
 
456 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1245  adenylosuccinate lyase  58.59 
 
 
463 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00902866  normal  0.920871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  59.96 
 
 
458 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4049  adenylosuccinate lyase  57.83 
 
 
459 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  58.98 
 
 
462 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0889  adenylosuccinate lyase  58.09 
 
 
461 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  56.52 
 
 
459 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  58.07 
 
 
455 aa  538  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  58.76 
 
 
482 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4662  adenylosuccinate lyase  56.96 
 
 
459 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163843  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3914  adenylosuccinate lyase  57.17 
 
 
483 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0304916  hitchhiker  0.00468958 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1126  adenylosuccinate lyase  58.09 
 
 
461 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  59.01 
 
 
456 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 
459 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 
459 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  59.19 
 
 
457 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  58.78 
 
 
456 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  60.31 
 
 
483 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  58.78 
 
 
456 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  57.59 
 
 
456 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  58.78 
 
 
456 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1146  adenylosuccinate lyase  57.71 
 
 
463 aa  532  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.17359  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  58.98 
 
 
462 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  58.78 
 
 
456 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  59.2 
 
 
482 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  60.04 
 
 
462 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  57.62 
 
 
481 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  56.3 
 
 
459 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  58.98 
 
 
462 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  57.52 
 
 
455 aa  530  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  58.84 
 
 
478 aa  530  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 
456 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  58.3 
 
 
451 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 
456 aa  526  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  58.61 
 
 
456 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  57.34 
 
 
456 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1158  adenylosuccinate lyase  56.74 
 
 
459 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>