More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4111 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  71.96 
 
 		 481 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  72.59 
 
 		 459 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  73.26 
 
 		 459 aa  700    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1158  adenylosuccinate lyase  70.68 
 
 		 459 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4049  adenylosuccinate lyase  75.88 
 
 		 459 aa  725    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4662  adenylosuccinate lyase  71.49 
 
 		 459 aa  681    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163843  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4111  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 457 aa  937    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  68.07 
 
 		 462 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  73.26 
 
 		 459 aa  700    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3914  adenylosuccinate lyase  70.39 
 
 		 483 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0304916  hitchhiker  0.00468958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  79.47 
 
 		 457 aa  722    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  72.83 
 
 		 459 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  67.63 
 
 		 462 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 458 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  66.96 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  67.18 
 
 		 462 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  66.96 
 
 		 462 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 457 aa  629  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 483 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  67.18 
 
 		 457 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 482 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  66.96 
 
 		 462 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  67.33 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  66.96 
 
 		 457 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  66.52 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 458 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 462 aa  618  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  67.18 
 
 		 482 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 462 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  66.08 
 
 		 456 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  64.99 
 
 		 459 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  65.56 
 
 		 455 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  64.16 
 
 		 483 aa  601  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  63.66 
 
 		 456 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  62.53 
 
 		 455 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  61.59 
 
 		 459 aa  595  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  64.68 
 
 		 455 aa  588  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  62.03 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  60.04 
 
 		 455 aa  580  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  61.59 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3412  adenylosuccinate lyase  64.32 
 
 		 458 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.507882  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  62.91 
 
 		 455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  59.38 
 
 		 456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  61.44 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  61.95 
 
 		 460 aa  568  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  60.04 
 
 		 478 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  60.04 
 
 		 456 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  60.26 
 
 		 456 aa  570  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  58.94 
 
 		 455 aa  565  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  59.38 
 
 		 457 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  62.25 
 
 		 455 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  62.47 
 
 		 454 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  60.26 
 
 		 456 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  59.38 
 
 		 462 aa  561  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  60.71 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 472 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  60.49 
 
 		 472 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  60.98 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  58.97 
 
 		 456 aa  555  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  58.35 
 
 		 456 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  59.16 
 
 		 455 aa  551  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  58.35 
 
 		 456 aa  554  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  60.75 
 
 		 455 aa  554  1e-156  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  58.35 
 
 		 456 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  60.71 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  58.97 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  59.87 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  58.5 
 
 		 455 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  58.74 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1245  adenylosuccinate lyase  59.03 
 
 		 463 aa  549  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00902866  normal  0.920871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  59.19 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  57.17 
 
 		 465 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  58.76 
 
 		 455 aa  548  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  58.3 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  58.3 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  58.74 
 
 		 455 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  59.42 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  59.42 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  58.3 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  58.57 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  61.28 
 
 		 455 aa  547  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  58.52 
 
 		 456 aa  547  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1146  adenylosuccinate lyase  59.03 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.17359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  58.57 
 
 		 456 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>