More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2635 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 		 456 aa  739    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  75.16 
 
 		 456 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  68.51 
 
 		 472 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  74.29 
 
 		 456 aa  725    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  68.51 
 
 		 456 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 		 456 aa  739    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  73.63 
 
 		 455 aa  720    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  75.44 
 
 		 478 aa  718    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  69.18 
 
 		 456 aa  652    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 		 456 aa  728    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  93.19 
 
 		 456 aa  890    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  87.28 
 
 		 456 aa  845    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 456 aa  941    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  70.29 
 
 		 456 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  71.33 
 
 		 457 aa  678    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  92.09 
 
 		 456 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  74.29 
 
 		 456 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  73.41 
 
 		 455 aa  725    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  71.4 
 
 		 472 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  75.66 
 
 		 456 aa  717    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  69.62 
 
 		 471 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  88.35 
 
 		 456 aa  856    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  92.31 
 
 		 456 aa  884    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  87.03 
 
 		 456 aa  850    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  73.9 
 
 		 456 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  72.97 
 
 		 456 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  67.19 
 
 		 465 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  73.41 
 
 		 456 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  74.29 
 
 		 456 aa  725    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  74.78 
 
 		 456 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  75.6 
 
 		 456 aa  739    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  75.16 
 
 		 456 aa  735    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  71.11 
 
 		 459 aa  671    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 		 456 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 		 456 aa  739    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  88.38 
 
 		 456 aa  853    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  69.42 
 
 		 454 aa  649    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0423  adenylosuccinate lyase  63.96 
 
 		 463 aa  641    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  75.6 
 
 		 456 aa  739    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  68.51 
 
 		 472 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  73.63 
 
 		 456 aa  720    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  75.38 
 
 		 456 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  71.65 
 
 		 455 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  69.89 
 
 		 455 aa  681    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  97.81 
 
 		 456 aa  927    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  97.59 
 
 		 456 aa  927    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  89.23 
 
 		 456 aa  853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 		 455 aa  718    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  70.07 
 
 		 456 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  72.97 
 
 		 456 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  72.97 
 
 		 456 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  75.38 
 
 		 456 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  68.96 
 
 		 472 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 		 456 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  69.84 
 
 		 456 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  97.37 
 
 		 456 aa  925    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  92.31 
 
 		 456 aa  884    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  87.69 
 
 		 455 aa  851    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 		 456 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  85.96 
 
 		 456 aa  824    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  92.09 
 
 		 456 aa  882    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  74.51 
 
 		 457 aa  713    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  69.2 
 
 		 455 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  70.76 
 
 		 455 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  69.18 
 
 		 462 aa  654    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  73.85 
 
 		 456 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29392  predicted protein  64.06 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.881924 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  65.27 
 
 		 458 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  65.02 
 
 		 458 aa  611  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  63.25 
 
 		 453 aa  610  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  62.5 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  61.83 
 
 		 455 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  60.94 
 
 		 455 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  63.19 
 
 		 469 aa  593  1e-168  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  62.56 
 
 		 483 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  60.94 
 
 		 455 aa  586  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  61.52 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 457 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  62.56 
 
 		 459 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  59.73 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  62.72 
 
 		 457 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  62.28 
 
 		 457 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 483 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  62.5 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  61.92 
 
 		 455 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 462 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 462 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  62.42 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1146  adenylosuccinate lyase  61.33 
 
 		 463 aa  568  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.17359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>