More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0518 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  66.89 
 
 		 456 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  68.71 
 
 		 472 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  68.05 
 
 		 456 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  71.21 
 
 		 457 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 456 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  68.71 
 
 		 456 aa  651    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  67.61 
 
 		 478 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  68.35 
 
 		 462 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  70.77 
 
 		 457 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  69.37 
 
 		 472 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  69.08 
 
 		 455 aa  663    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  70.77 
 
 		 458 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  66.82 
 
 		 456 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  69.23 
 
 		 462 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 456 aa  930    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 455 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  67.61 
 
 		 471 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  69.23 
 
 		 482 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  71.43 
 
 		 457 aa  662    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  68.57 
 
 		 462 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  68.35 
 
 		 462 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  68.05 
 
 		 472 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 456 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  68.71 
 
 		 456 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 460 aa  637    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  66.59 
 
 		 456 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  69.01 
 
 		 483 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  648    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  69.23 
 
 		 462 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  69.23 
 
 		 462 aa  648    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  68.57 
 
 		 462 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  72.15 
 
 		 456 aa  687    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  70.11 
 
 		 462 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  68.49 
 
 		 456 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  67.76 
 
 		 454 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  66.3 
 
 		 456 aa  640    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  69.89 
 
 		 458 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  69.01 
 
 		 462 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  65.57 
 
 		 455 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 456 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 456 aa  636    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 456 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  68.93 
 
 		 462 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  68.57 
 
 		 462 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  69.23 
 
 		 462 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  68.49 
 
 		 456 aa  652    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3412  adenylosuccinate lyase  71.52 
 
 		 458 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.507882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  68.05 
 
 		 456 aa  647    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  66.45 
 
 		 455 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  69.01 
 
 		 462 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  65.13 
 
 		 456 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 456 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  70.55 
 
 		 462 aa  655    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  67.71 
 
 		 456 aa  639    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  67.26 
 
 		 456 aa  644    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  68.86 
 
 		 455 aa  653    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  68.49 
 
 		 472 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  67.61 
 
 		 456 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  66.01 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  67.11 
 
 		 459 aa  632  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  65.03 
 
 		 456 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  69.01 
 
 		 482 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  67.83 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 456 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  65.48 
 
 		 456 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 457 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  68.57 
 
 		 483 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  65.35 
 
 		 456 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  68.57 
 
 		 462 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  66.37 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  69.3 
 
 		 455 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  64.81 
 
 		 456 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  64.47 
 
 		 456 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  66.81 
 
 		 483 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  64.91 
 
 		 455 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  65.7 
 
 		 456 aa  623  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  65.48 
 
 		 456 aa  622  1e-177  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  65.26 
 
 		 456 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  65.26 
 
 		 456 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  63.82 
 
 		 455 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  65.26 
 
 		 456 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  64.04 
 
 		 455 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  65.49 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  65.79 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  66.81 
 
 		 459 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  67.83 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  66.01 
 
 		 455 aa  610  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  63.99 
 
 		 459 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  63.99 
 
 		 459 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>