More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1238 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5015  adenylosuccinate lyase  73.76 
 
 		 448 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06215  adenylosuccinate lyase  73.76 
 
 		 445 aa  672    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 443 aa  911    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3540  adenylosuccinate lyase  66.97 
 
 		 451 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2933  adenylosuccinate lyase  67.42 
 
 		 448 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5955  adenylosuccinate lyase  66.29 
 
 		 446 aa  614  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.676724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1563  adenylosuccinate lyase  64.71 
 
 		 456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  63.8 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  55.3 
 
 		 456 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  55.88 
 
 		 457 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  56.21 
 
 		 471 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  55.53 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  55.76 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  56.21 
 
 		 456 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 		 455 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  55.3 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  54.73 
 
 		 451 aa  484  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  54.85 
 
 		 456 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  54.63 
 
 		 456 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  55.18 
 
 		 455 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  53.72 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 456 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  55.08 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  54.63 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  54.63 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  53.5 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  54.4 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  52.71 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  52.03 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 455 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  52.03 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  52.03 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  52.14 
 
 		 456 aa  468  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  52.14 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  54.28 
 
 		 455 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  53.27 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  52.82 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  52.37 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  52.82 
 
 		 456 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  53.95 
 
 		 455 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  51.92 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  51.92 
 
 		 456 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  52.14 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 		 456 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  52.14 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  53.27 
 
 		 459 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  52.25 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  52.6 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  53.6 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  52.49 
 
 		 458 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  53.26 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  51.81 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  52.26 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  52.04 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  52.26 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  51.47 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  52.37 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  51.36 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 		 455 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  51.69 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  51.57 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  51.36 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  51.58 
 
 		 462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  50.9 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>