More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1563 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5955  adenylosuccinate lyase  69.35 
 
 		 446 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.676724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1563  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 456 aa  939    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3540  adenylosuccinate lyase  66.67 
 
 		 451 aa  624  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  66.44 
 
 		 446 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2933  adenylosuccinate lyase  65.32 
 
 		 448 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06215  adenylosuccinate lyase  66.29 
 
 		 445 aa  592  1e-168  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  64.71 
 
 		 443 aa  589  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5015  adenylosuccinate lyase  64.72 
 
 		 448 aa  583  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  62.11 
 
 		 447 aa  576  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  53.24 
 
 		 457 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  52.31 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  52.93 
 
 		 455 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  51.79 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  52.01 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 465 aa  461  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 456 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  51.56 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 472 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  51 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  51 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  51.22 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  51.34 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 456 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 456 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 456 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  51 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  50.78 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 472 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  50.44 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  51 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  49.78 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1245  adenylosuccinate lyase  52.24 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00902866  normal  0.920871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  50.33 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  50.89 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1146  adenylosuccinate lyase  52.47 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.17359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  49.55 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  50.22 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 		 482 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 483 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 455 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  51.44 
 
 		 457 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 455 aa  441  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  50.79 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4111  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174972 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 456 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>