More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0043 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  94.01 
 
 		 451 aa  860    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1673  adenylosuccinate lyase  71.43 
 
 		 465 aa  641    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 451 aa  907    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  67.41 
 
 		 458 aa  628  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0889  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  54.42 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1126  adenylosuccinate lyase  50.44 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  54.41 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  53.33 
 
 		 455 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  51.44 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  53.64 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  54 
 
 		 455 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  53.1 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  53.86 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  53.86 
 
 		 462 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  53.44 
 
 		 460 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  50.67 
 
 		 455 aa  455  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  53.45 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  51.12 
 
 		 458 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  52.7 
 
 		 455 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  51.22 
 
 		 457 aa  451  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  53.22 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3412  adenylosuccinate lyase  53.33 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.507882  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  53.86 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1273  adenylosuccinate lyase  51.79 
 
 		 455 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4049  adenylosuccinate lyase  51.31 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  52.88 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  53.86 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  49.45 
 
 		 455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  53.86 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  53.32 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  448  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  49.33 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  52.56 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  52.77 
 
 		 455 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  52.76 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  51.76 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  52.76 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  53.98 
 
 		 457 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  51.67 
 
 		 455 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  53.64 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  49.56 
 
 		 451 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  51.76 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  53.64 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  53.2 
 
 		 483 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4662  adenylosuccinate lyase  50.87 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163843  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  51.99 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  52.54 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  48.54 
 
 		 456 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  50.45 
 
 		 456 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  52.54 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  52.54 
 
 		 462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  51.33 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 447 aa  442  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  50.68 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  48.87 
 
 		 456 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3540  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  51.32 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  53.44 
 
 		 458 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  51.13 
 
 		 455 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  49.44 
 
 		 455 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  51.33 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  50.23 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  52.76 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4111  adenylosuccinate lyase  53.76 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  50 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0026  adenylosuccinate lyase  52.33 
 
 		 455 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  49.21 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  51.45 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>