More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3246 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3246  adenylosuccinate lyase  100 
 
 
458 aa  929    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4199  adenylosuccinate lyase  69.2 
 
 
451 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225542  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0043  adenylosuccinate lyase  67.41 
 
 
451 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1673  adenylosuccinate lyase  65.1 
 
 
465 aa  590  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  51.88 
 
 
455 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  50.77 
 
 
460 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 
457 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3540  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 
451 aa  432  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 
456 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 
456 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 
472 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 
456 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 
456 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0889  adenylosuccinate lyase  48.13 
 
 
461 aa  432  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 
456 aa  431  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  48.87 
 
 
456 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1745  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 
456 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  48.88 
 
 
455 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  50.11 
 
 
455 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 
456 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1123  adenylosuccinate lyase  49.66 
 
 
447 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 
456 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 
456 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0834  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 
456 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 
456 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1126  adenylosuccinate lyase  47.91 
 
 
461 aa  431  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2627  adenylosuccinate lyase  50.88 
 
 
455 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108718  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 
456 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0805  adenylosuccinate lyase  50.34 
 
 
455 aa  428  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1593  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 
455 aa  429  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  47.87 
 
 
456 aa  428  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2480  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 
456 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.866176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  48.65 
 
 
456 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 
455 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0863  adenylosuccinate lyase  48.78 
 
 
456 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1718  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 
456 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2235  adenylosuccinate lyase  47.65 
 
 
456 aa  428  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0334521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  48.55 
 
 
456 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1137  adenylosuccinate lyase  47.22 
 
 
465 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2853  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 
456 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1610  adenylosuccinate lyase  48.32 
 
 
456 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  48.1 
 
 
455 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  47.67 
 
 
456 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  47.43 
 
 
456 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0892  adenylosuccinate lyase  49.45 
 
 
465 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0715045  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1238  adenylosuccinate lyase  51.24 
 
 
443 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  49.22 
 
 
472 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  49 
 
 
456 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1784  adenylosuccinate lyase  48.89 
 
 
453 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.47541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2020  adenylosuccinate lyase  48.1 
 
 
456 aa  425  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581783  normal  0.312762 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
455 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2152  adenylosuccinate lyase  48.42 
 
 
456 aa  423  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  46.89 
 
 
455 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1358  adenylosuccinate lyase  50.56 
 
 
455 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  46.53 
 
 
456 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  49 
 
 
472 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4037  adenylosuccinate lyase  48.99 
 
 
446 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.499217  normal  0.07553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  49 
 
 
472 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  48.56 
 
 
456 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  48.34 
 
 
471 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  48.2 
 
 
456 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  46.53 
 
 
456 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  50 
 
 
454 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1032  adenylosuccinate lyase  49.89 
 
 
458 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.423861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5015  adenylosuccinate lyase  47.67 
 
 
448 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  46.99 
 
 
455 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  49.45 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  47.01 
 
 
456 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2646  adenylosuccinate lyase  46.98 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.147554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  48.34 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  46.9 
 
 
456 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  48.11 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2065  adenylosuccinate lyase  48.1 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1849  adenylosuccinate lyase  49.67 
 
 
455 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0423  adenylosuccinate lyase  46.24 
 
 
463 aa  415  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  48.34 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2736  adenylosuccinate lyase  50.54 
 
 
465 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286756  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  48.24 
 
 
469 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  49.01 
 
 
462 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  47.92 
 
 
462 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1563  adenylosuccinate lyase  46.78 
 
 
456 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.36052  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  47.01 
 
 
478 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2933  adenylosuccinate lyase  47.77 
 
 
448 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.122717 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  48.57 
 
 
462 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>