More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2880 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2880  MgtC/SapB transporter  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5458  MgtC/SapB transporter  50.24 
 
 
212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0240  MgtC/SapB transporter  46.57 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.127805  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1302  MgtC/SapB transporter  45.06 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4064  MgtC/SapB transporter  36.41 
 
 
224 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000443818  normal  0.0844762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0469  MgtC/SapB transporter  44.03 
 
 
165 aa  111  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28060  uncharacterized membrane protein  42.96 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  39.77 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  39.77 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  39.77 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  39.77 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  39.77 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  39.77 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  39.77 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  41.94 
 
 
221 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  39.18 
 
 
215 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  37.13 
 
 
232 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1179  MgtC/SapB transporter  45.11 
 
 
238 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2643  MgtC/SapB transporter  47.58 
 
 
221 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139935  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3566  MgtC/SapB transporter  42.97 
 
 
238 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3045  MgtC/SapB transporter  39.88 
 
 
232 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0823  MgtC/SapB transporter  40.72 
 
 
237 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.131 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0397  MgtC family membrane protein  39.08 
 
 
243 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3612  MgtC family protein  43.84 
 
 
221 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0572  MgtC family protein  32.58 
 
 
240 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4213  MgtC family protein  40.91 
 
 
233 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00310704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0271  MgtC/SapB transporter  34.36 
 
 
215 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000391256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0558  cation transport ATPase yqgG  31.87 
 
 
240 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0863  MgtC family protein  36.9 
 
 
227 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  41.61 
 
 
219 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  41.61 
 
 
219 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4255  MgtC family protein  38.13 
 
 
234 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0280908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  41.61 
 
 
219 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0748  MgtC/SapB transporter  46.88 
 
 
133 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  33.89 
 
 
225 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2688  MgtC/SapB transporter  40.69 
 
 
235 aa  101  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.269856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05430  uncharacterized membrane protein  39.44 
 
 
244 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  42.06 
 
 
225 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3635  MgtC/SapB transporter  43.06 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.963733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4309  MgtC/SapB transporter  36.93 
 
 
236 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4104  MgtC/SapB transporter  37.59 
 
 
168 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214315  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2176  MgtC family protein  39.63 
 
 
231 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.373098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0141  MgtC/SapB transporter  33.96 
 
 
235 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.8 
 
 
227 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2831  Mg2+ transporter  48.04 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.262591  normal  0.261086 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1632  Mg2+ transporter  48.04 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  47.37 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1743  MgtC/SapB transporter  48.04 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1856  MgtC family protein  38.41 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306879  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2126  MgtC family protein  38.41 
 
 
243 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1748  MgtC family protein  38.41 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0307  MgtC family membrane protein  38.41 
 
 
243 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0862  MgtC family protein  38.41 
 
 
243 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1150  MgtC family protein  38.41 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  35.96 
 
 
227 aa  99  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3916  MgtC/SapB transporter  37.04 
 
 
140 aa  99  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1557  putative MgtC-magnesium transport family protein  39.29 
 
 
232 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0695267 
 
 
-
 
NC_002936  DET0829  MgtC/SapB family membrane protein  47.66 
 
 
133 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.439532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_733  membrane protein, MgtC / SapB family  46.88 
 
 
133 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.787081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5027  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0246703  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2310  MgtC/SapB transporter  38.06 
 
 
238 aa  97.8  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163338  normal  0.143975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0206  MgtC/SapB transporter  41.22 
 
 
191 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  43.55 
 
 
237 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4764  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  35.39 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  46.49 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5006  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2623  MgtC/SapB transporter  45.61 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0207  sapB protein  40.85 
 
 
226 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000857338  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0931  MgtC/SapB transporter  41.35 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0155  MgtC/SapB transporter  42.75 
 
 
234 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0848  MgtC/SapB transporter  42.11 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  42.74 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4307  MgtC/SapB transporter  34.55 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177022  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  41.88 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1861  MgtC/SapB transporter  33.69 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6766  MgtC/SapB transporter  35.95 
 
 
238 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0200103  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  31.93 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1728  Mg2+ transporter  35.29 
 
 
223 aa  95.9  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0882538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3323  MgtC/SapB transporter  47.22 
 
 
240 aa  95.9  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0921  MgtC/SapB transporter  31.95 
 
 
248 aa  95.5  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000837465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1330  putative MgtC-magnesium transport family protein  42.11 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  30.6 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  38.76 
 
 
229 aa  95.1  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  33.65 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2567  MgtC/SapB transporter  49 
 
 
230 aa  94.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  33.65 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  33.65 
 
 
225 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1344  hypothetical protein  45.67 
 
 
245 aa  94.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.753659  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  41.41 
 
 
225 aa  94.7  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  38.03 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0787  MgtC/SapB transporter  41.67 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0269913 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4554  MgtC/SapB transporter  43.38 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1155  MgtC family protein  31.98 
 
 
228 aa  94  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0257745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  33.17 
 
 
225 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2563  MgtC/SapB transporter  37.58 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>