More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0377 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0377  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2215  flagellar biosynthesis protein FliP  84.3 
 
 
293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2731  flagellar biosynthesis protein FliP  71.88 
 
 
231 aa  343  8.999999999999999e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2917  flagellar biosynthesis protein FliP  78.67 
 
 
235 aa  338  5e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.370836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3583  flagellar biosynthesis protein FliP  78.67 
 
 
237 aa  333  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3097  flagellar biosynthesis protein FliP  56.05 
 
 
250 aa  269  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  56.82 
 
 
252 aa  264  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  55.16 
 
 
251 aa  262  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3824  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
247 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  55.41 
 
 
245 aa  261  6.999999999999999e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3908  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
247 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  56.56 
 
 
248 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  55.14 
 
 
255 aa  258  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  55.8 
 
 
244 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  55.8 
 
 
244 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  55.8 
 
 
244 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2396  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
257 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  54.46 
 
 
244 aa  254  7e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0755  flagellar biosynthesis protein FliP  53.36 
 
 
244 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
256 aa  252  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  55.61 
 
 
238 aa  251  7e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3440  flagellar biosynthesis protein FliP  52.91 
 
 
257 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1319  flagellar biosynthetic protein FliP  53.99 
 
 
247 aa  246  2e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  51.87 
 
 
252 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0689  flagellar biosynthesis protein FliP  54.26 
 
 
243 aa  246  3e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0220519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
222 aa  245  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2812  flagellar biosynthesis protein FliP  54.13 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.286777  normal  0.0482337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2018  flagellar biosynthesis protein FliP  54.29 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3681  flagellar biosynthesis protein FliP  52.29 
 
 
255 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0497178  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  52.29 
 
 
251 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  52.05 
 
 
289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16720  flagellar biosynthetic protein FliP  55.79 
 
 
254 aa  238  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002825  flagellar biosynthesis protein FliP  52.51 
 
 
289 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4355  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 
251 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380613  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  51.57 
 
 
260 aa  238  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3444  flagellar biosynthesis protein FliP  52.29 
 
 
250 aa  237  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1511  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 
251 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal  0.136143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1972  flagellar biosynthetic protein FliP  52.29 
 
 
250 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000346072  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  52.31 
 
 
260 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1017  flagellar biosynthesis protein FliP  50.9 
 
 
246 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.830482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  52.88 
 
 
280 aa  235  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1549  flagellar biosynthesis protein FliP  50.92 
 
 
252 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0314231  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0700  flagellar biosynthesis protein FliP  54.71 
 
 
256 aa  234  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0785265  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45770  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 
255 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2033  flagellar biosynthetic protein FliP  53.81 
 
 
223 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3881  flagellar biosynthesis protein FliP  51.38 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  52.49 
 
 
299 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4138  flagellar biosynthesis protein FliP  57.8 
 
 
259 aa  231  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00317054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  50.69 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3565  flagellar biosynthesis protein FliP  52.44 
 
 
260 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.809512  normal  0.917839 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
255 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  50.23 
 
 
251 aa  229  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  53.2 
 
 
251 aa  228  6e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2195  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2137  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.228674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
247 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1140  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00639751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1263  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.708489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2142  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  hitchhiker  0.00210963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  227  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  50.67 
 
 
262 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  226  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2048  flagellar biosynthesis protein FliP  53.7 
 
 
245 aa  225  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000326418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
248 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  49.08 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1677  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 
221 aa  225  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1700  flagellar biosynthetic protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000581149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1694  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  223  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  normal  0.027037 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2725  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0168836  normal  0.329984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2181  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000241954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  47.71 
 
 
248 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1236  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1069  flagellar biosynthesis protein FliP  53.24 
 
 
245 aa  223  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  51.6 
 
 
251 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1968  flagellar biosynthesis protein FliP  51.87 
 
 
250 aa  222  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0641243  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  47.71 
 
 
248 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  47.71 
 
 
252 aa  221  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2035  flagellar biosynthesis protein FliP  46.35 
 
 
266 aa  221  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168602  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1753  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1753  flagellar biosynthesis protein FliP  52.27 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2011  flagellar biosynthetic protein FliP  50 
 
 
276 aa  220  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2331  flagellar biosynthesis protein FliP  46.15 
 
 
293 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2539  flagellar biosynthesis protein FliP  51.85 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.448606  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  48.64 
 
 
253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  47.51 
 
 
266 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1610  flagellar biosynthesis protein FliP  55.03 
 
 
253 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.799171  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  47.25 
 
 
253 aa  219  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  47.71 
 
 
247 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2976  flagellar biosynthetic protein FliP  49.49 
 
 
262 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0648  flagellar biosynthesis protein FliP  46.73 
 
 
261 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  45.79 
 
 
255 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4385  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 
262 aa  217  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0243  flagellar biosynthesis protein FliP  49.77 
 
 
253 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.990062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  47.66 
 
 
245 aa  216  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0786  flagellar biosynthesis protein FliP  56.04 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000685779  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>