More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0427 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48 
 
 
307 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
310 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
310 aa  215  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 
308 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0850  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  35.86 
 
 
301 aa  205  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2888  putative UDP-glucose 4-epimerase  37.01 
 
 
309 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1847  UDP-glucose 4-epimerase  35.39 
 
 
317 aa  158  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.336736 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
325 aa  139  7.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
306 aa  137  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
317 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
310 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.56 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  33.33 
 
 
337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  36.36 
 
 
331 aa  127  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
310 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
308 aa  126  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 
332 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
292 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 
309 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
299 aa  122  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  35.49 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.53 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.04 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.78 
 
 
304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
292 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.87 
 
 
307 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 
328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  32.71 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  32.01 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  33.93 
 
 
337 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 
329 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  32.14 
 
 
336 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  32.01 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  34.19 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249986  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  28.91 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.59 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  33.01 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
327 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  30.86 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
324 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  30.36 
 
 
336 aa  112  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  31.14 
 
 
324 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000109546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  34.04 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  33.13 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  31.1 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
326 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  29.06 
 
 
325 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  28.27 
 
 
326 aa  109  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.34 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.39 
 
 
322 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
309 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
343 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  32.74 
 
 
337 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
309 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
309 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  31.72 
 
 
338 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  32.52 
 
 
330 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  28.74 
 
 
328 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.97 
 
 
320 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
313 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
312 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.45 
 
 
323 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  28.1 
 
 
302 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  28.53 
 
 
324 aa  106  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  31.6 
 
 
327 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  28.09 
 
 
321 aa  106  6e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  27.96 
 
 
330 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  26.06 
 
 
326 aa  105  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
339 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  32.44 
 
 
337 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  34.87 
 
 
337 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  33.63 
 
 
328 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.9 
 
 
328 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.99 
 
 
295 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000000196986 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  30.25 
 
 
327 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
316 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>