183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0693 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0693  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1811  anti-sigma-factor antagonist  70.43 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0163  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.438455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0676  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.483964  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0736  anti-sigma-factor antagonist  41.28 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5778  anti-sigma-factor antagonist  37.17 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2794  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3136  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0981532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2487  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.27 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2415  anti-sigma-factor antagonist  37.27 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2268  anti-sigma-factor antagonist  37.84 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0140  anti-sigma-factor antagonist  39.5 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00670241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4971  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.32 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1218  negative regulator of sigma-B  35.71 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0130  anti-sigma-factor antagonist  34.55 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3743  anti-sigma-factor antagonist  39.25 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2683  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0475  anti-sigma-factor antagonist  39.09 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0800  anti-sigma-factor antagonist  37.38 
 
 		 123 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0977014  hitchhiker  0.00820415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2117  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.04 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0196  anti-sigma-factor antagonist  37.86 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0995683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3438  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0775335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2971  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1493  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.423658  normal  0.0757983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4410  anti-sigma-factor antagonist  34.82 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3767  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0691716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3340  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0511  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5230  anti-sigma-factor antagonist  32.14 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6566  anti-sigma-factor antagonist  38.18 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778948  normal  0.044329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1474  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.71 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000611379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1672  negative regulator of sigma-B  30 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 331 aa  73.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3134  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  30 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  37 
 
 		 362 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  36.45 
 
 		 341 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  35.9 
 
 		 308 aa  70.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  36.28 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3858  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 341 aa  64.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3857  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 359 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  29.13 
 
 		 433 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  28.45 
 
 		 325 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  33.04 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1936  anti-sigma-factor antagonist  32.71 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.729747  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2646  anti-sigma-factor antagonist  34.58 
 
 		 261 aa  62  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  36.73 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  38.54 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  30.7 
 
 		 430 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  29.82 
 
 		 428 aa  62  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.43 
 
 		 285 aa  61.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0141  anti-sigma-factor antagonist  34.26 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0116373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 371 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 357 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1239  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.974707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  31.82 
 
 		 370 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  32.76 
 
 		 344 aa  61.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  34.91 
 
 		 283 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 385 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 366 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  34.51 
 
 		 365 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  35.83 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.62 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 655 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  30.97 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.12 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0092  anti-sigma-factor antagonist  31.78 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.463616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  32.17 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 653 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  32.76 
 
 		 424 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  31.53 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 		 429 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 283 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  29.06 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  30.17 
 
 		 445 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32010  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  28.04 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0737154  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 		 653 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.91 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  28.32 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  32.14 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  31.86 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>