More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0540 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0540  replicative DNA helicase  100 
 
 		 458 aa  931    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.426524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_481  replicative DNA helicase  98.47 
 
 		 458 aa  921    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0516  primary replicative DNA helicase  97.38 
 
 		 458 aa  912    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  47.35 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.65 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.76 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  46.89 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  46.89 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  46.38 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.07 
 
 		 448 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  41.65 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  41.87 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  41.8 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  43.7 
 
 		 454 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  42.42 
 
 		 444 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 447 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  43.56 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.14 
 
 		 449 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 440 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  42.06 
 
 		 459 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 449 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.28 
 
 		 471 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 449 aa  349  5e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  41.81 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  40.94 
 
 		 455 aa  348  9e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 456 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  40.53 
 
 		 457 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 445 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  39.42 
 
 		 460 aa  343  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  43.3 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  40 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.08 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.08 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  41.24 
 
 		 468 aa  343  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.8 
 
 		 442 aa  343  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  42.51 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  41.28 
 
 		 444 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  39.37 
 
 		 461 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  39.78 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  41.28 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  40.85 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  44 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  42.54 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  43.13 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  41.96 
 
 		 460 aa  340  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  42.86 
 
 		 460 aa  339  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  47.41 
 
 		 593 aa  339  8e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  42.63 
 
 		 460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  42.86 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  42.41 
 
 		 471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 461 aa  335  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  42.41 
 
 		 460 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  39.15 
 
 		 451 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  41.36 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  39.82 
 
 		 454 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  40.97 
 
 		 513 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  40.48 
 
 		 529 aa  333  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.11 
 
 		 509 aa  333  5e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  39.51 
 
 		 459 aa  333  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 512 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  38.84 
 
 		 461 aa  331  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  41.33 
 
 		 443 aa  331  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 449 aa  330  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  40.56 
 
 		 443 aa  330  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  41.69 
 
 		 458 aa  330  4e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.78 
 
 		 465 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  40.62 
 
 		 457 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  40.62 
 
 		 457 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  38.77 
 
 		 460 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  40.83 
 
 		 476 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.03 
 
 		 442 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  39.91 
 
 		 466 aa  326  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  41.74 
 
 		 471 aa  326  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  41.43 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  41.43 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  41.2 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  37.83 
 
 		 460 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.5 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  40 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  42.28 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  39.74 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  40.57 
 
 		 476 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>