194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0210 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0210  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  527  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  84.31 
 
 
284 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.1 
 
 
337 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.08 
 
 
260 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  29.87 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
335 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
256 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
345 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
513 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0335  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
476 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0145  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
307 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0208  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.27 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  22.98 
 
 
333 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.57 
 
 
1157 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  37.5 
 
 
481 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
247 aa  52.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
322 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 
331 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
479 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.18 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  27.39 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  29.03 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  24.78 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  29.03 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  26.18 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.17 
 
 
637 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  26.73 
 
 
353 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
363 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  28.23 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  28.23 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  28.23 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0481  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
321 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  28.23 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  28.23 
 
 
344 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  36.14 
 
 
308 aa  48.9  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
407 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  39.44 
 
 
410 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  22.6 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.12 
 
 
479 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.34 
 
 
327 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  34.21 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
322 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 
335 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  39.44 
 
 
410 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
362 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 
233 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
303 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
344 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  22.82 
 
 
313 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 
493 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 
397 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  32.05 
 
 
785 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.48 
 
 
327 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
327 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
344 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  22.65 
 
 
341 aa  45.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 
752 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
329 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.28 
 
 
327 aa  45.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
389 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.28 
 
 
327 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  23.28 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  43.55 
 
 
410 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1772  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.293765  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1391  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2402  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.745168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.25 
 
 
461 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2192  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000025698  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
1035 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3794  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
302 aa  45.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.33 
 
 
345 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1881  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.254489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0016  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2238  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2276  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1153  undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  28.92 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.33 
 
 
328 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  40.28 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  23.28 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  29.79 
 
 
290 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>