More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3364 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3364  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000215614  normal  0.253419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1539  extracellular solute-binding protein family 3  66.34 
 
 
307 aa  428  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
510 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
499 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.85 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
270 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
264 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 
266 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.96 
 
 
264 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 
264 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
264 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
264 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
264 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.8 
 
 
266 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.98 
 
 
264 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
266 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
264 aa  103  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
266 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
266 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  32.85 
 
 
264 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 
266 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.16 
 
 
267 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
266 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 
270 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  35.39 
 
 
266 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
284 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.16 
 
 
266 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.71 
 
 
264 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  34.31 
 
 
266 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.96 
 
 
264 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
290 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  31.36 
 
 
256 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  33.05 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  34.08 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.02 
 
 
502 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.02 
 
 
502 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.76 
 
 
248 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.65 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  31.95 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.89 
 
 
266 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  33.89 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  30.45 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.64 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.22 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.64 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.64 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.92 
 
 
266 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.8 
 
 
266 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.92 
 
 
266 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.92 
 
 
266 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  31.82 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.82 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 
252 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.73 
 
 
264 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.36 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  32.44 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.36 
 
 
264 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  33.63 
 
 
250 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  32 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  32 
 
 
264 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.86 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
264 aa  89.4  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  31.43 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  32.13 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.56 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 
247 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  31.86 
 
 
248 aa  87  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  29.51 
 
 
247 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  31.33 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
489 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
250 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  31.72 
 
 
489 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 
489 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.05 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
250 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>