More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1888 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1888  alanine racemase  100 
 
 		 392 aa  751    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1028  alanine racemase  53.97 
 
 		 368 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  46.01 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  41.4 
 
 		 370 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  40.16 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  34.85 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  40.69 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  37.86 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  40 
 
 		 370 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  36.53 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.31 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  35.83 
 
 		 373 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.86 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  39.89 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  35.12 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  36.94 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  34.91 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.04 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  34.56 
 
 		 391 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  34.74 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  34.3 
 
 		 391 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  34.56 
 
 		 391 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  34.31 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.92 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  33.94 
 
 		 391 aa  223  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  38.62 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  38.34 
 
 		 390 aa  222  9e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  34.04 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  40.27 
 
 		 851 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  36.04 
 
 		 375 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.16 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  33.77 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  33.77 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  38.06 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  33.42 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.06 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  38.42 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  38.42 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  32.71 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  38.42 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  38.42 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.81 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  38.16 
 
 		 389 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.3 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  38.16 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  38.16 
 
 		 389 aa  216  8e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  37.89 
 
 		 389 aa  215  9e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  34.75 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  34.68 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  39.1 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  37.97 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  32.54 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0280  alanine racemase region  38.71 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0768995 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.28 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  35.19 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  36.76 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  40.4 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  45.33 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  40.97 
 
 		 811 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1683  alanine racemase  35.01 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  35.37 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  35.37 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3057  alanine racemase  40.85 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0113499  normal  0.425267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  32.55 
 
 		 374 aa  200  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  35.54 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  35.61 
 
 		 411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0738  alanine racemase  40.33 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0231981  decreased coverage  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3637  alanine racemase  40.33 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000125734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0759  alanine racemase  39.78 
 
 		 358 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000059584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0522  alanine racemase  39.02 
 
 		 363 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000197654  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0717  alanine racemase  40.05 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00955236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  37.57 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  41.97 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3916  alanine racemase  38.96 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0747  alanine racemase  40.05 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00105431  hitchhiker  0.000194512 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0259  alanine racemase  35.03 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.060575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  32.89 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4206  alanine racemase  37.6 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0248673  decreased coverage  0.000000273108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1684  alanine racemase  35.2 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.531054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0693  alanine racemase  39.51 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00658355  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  41.67 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3247  alanine racemase  39.51 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000012106  hitchhiker  0.0000136882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0975  alanine racemase  32.71 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.585584  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0714  alanine racemase  39.51 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000257815  hitchhiker  0.000596589 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  37.3 
 
 		 388 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2783  alanine racemase  38.12 
 
 		 375 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000262761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  32.71 
 
 		 364 aa  189  7e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  36.08 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00017  alanine racemase  36.65 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  32.98 
 
 		 395 aa  188  1e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2284  alanine racemase  33.16 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0763  alanine racemase  39.51 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.347962  unclonable  0.0000000000881438 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  31.32 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  42.55 
 
 		 375 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3277  alanine racemase  39.6 
 
 		 358 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  39.84 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  40.53 
 
 		 395 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  35.86 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  34.48 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  41.32 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>