45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1812 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1812  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 386 aa  751    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  41.67 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 282 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  38.33 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  38.78 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  39.34 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4228  putative sensor protein  46.43 
 
 		 282 aa  46.2  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0809123  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5847  transcriptional regulator, MerR family  40.98 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1373  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 345 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  34.43 
 
 		 241 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 310 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2715  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  32.81 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  33.33 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 242 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 335 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 290 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 299 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5849  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>