More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2224 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2224  putative methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1323  conserved hypothetical protein, putative formyltransferase  47.81 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0072434  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0659  methionyl-tRNA formyltransferase  44.39 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116739  normal  0.867777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1247  GCN5-related N-acetyltransferase  41.36 
 
 		 418 aa  197  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.498575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02909  probable methionyl-tRNA formyltransferase  37.95 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0208  methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  31.76 
 
 		 404 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491531  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  29.95 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000190251  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1117  methionyl-tRNA formyltransferase  33.57 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  29.32 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  25.41 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  26.53 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  29.89 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1729  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2096  hypothetical protein  26.46 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0619627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  29.3 
 
 		 309 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  30.77 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  26.13 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  28.24 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  29.31 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  29.89 
 
 		 314 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0133  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0105  methionyl-tRNA formyltransferase  28.57 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02899  Methionyl-tRNA formyltransferase-like protein  32.37 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0140158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  36.47 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1499  formyl transferase domain protein  24.73 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290814  hitchhiker  0.000921551 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0093  methionyl-tRNA formyltransferase  27.82 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  30.17 
 
 		 315 aa  62  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  32.2 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  32.2 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  25.51 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1534  methionyl-tRNA formyltransferase  34.57 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  25.53 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0615  formyl transferase domain protein  26.01 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66152  normal  0.206084 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  25.52 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  25.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0678  methionyl-tRNA formyltransferase  35.79 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  25.64 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  27.47 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  25.41 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  22.52 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02540  methionyl-tRNA formyltransferase  27.01 
 
 		 312 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0264406  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1182  formyl transferase domain protein  27.33 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  27.22 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  26.88 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3097  hypothetical protein  29.71 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  22.6 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3677  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 		 327 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1928  methionyl-tRNA formyltransferase  21.9 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0020  methionyl-tRNA formyltransferase  23.78 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0506  methionyl-tRNA formyltransferase  23.59 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  25.42 
 
 		 303 aa  55.1  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  21.2 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  23.87 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  26.14 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0072  methionyl-tRNA formyltransferase  32.39 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  28.92 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2078  methionyl-tRNA formyltransferase  33.03 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  25.39 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  30.23 
 
 		 320 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  24.51 
 
 		 289 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5111  methionyl-tRNA formyltransferase  21.19 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.030161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  29.29 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1864  methionyl-tRNA formyltransferase  25.6 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3354  methionyl-tRNA formyltransferase  30.99 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  22.83 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  22.83 
 
 		 314 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  21.98 
 
 		 312 aa  53.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 		 318 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3564  methionyl-tRNA formyltransferase  24.85 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  29.89 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  23.45 
 
 		 311 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  23.31 
 
 		 359 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2246  methionyl-tRNA formyltransferase  27.65 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155767  hitchhiker  0.00775212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  21.89 
 
 		 668 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 317 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  21.9 
 
 		 320 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  27.38 
 
 		 348 aa  52.4  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  22 
 
 		 307 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0633  formyl transferase domain protein  26.57 
 
 		 312 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.353643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  26.67 
 
 		 318 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0019  methionyl-tRNA formyltransferase  26.88 
 
 		 327 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  29.55 
 
 		 307 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  24.43 
 
 		 317 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  28.02 
 
 		 319 aa  52  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.06 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  24.74 
 
 		 313 aa  52  0.000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3481  methionyl-tRNA formyltransferase  28.81 
 
 		 334 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.902308 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  25.93 
 
 		 311 aa  52  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4081  methionyl-tRNA formyltransferase  23.87 
 
 		 330 aa  51.6  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>